左旋肉碱主要影响胃肠道和心脏。过量食用左旋肉碱人体会大量腹泻，从而导致人体脱水，电解质丢失，出现低钾血症，低钠血症，低钙血症等，人体可出现头晕，乏力等；还会影响心脏，体质较弱的人会出现心跳加快，心慌，气紧，胸憋等，严重还可能诱发心律失常；多数人在服用了左旋肉碱后出左旋肉碱减肥副作用现失眠，入睡困难，还有的出现营养不良，消瘦，进而代谢异常。